Výzkum - Granty
Výzkum diversity papillomavirů u pacientek s cervikálními dysplasiemi v České republice za použití polymerázové řetězové reakce
Doba řešení: 1994 - 1996
Grant: GAČR 312/94/0886
Hlavní řešitel: RNDr. Ruth Tachezy Ph.D., Ústav hematologie a krevní transfúze
Klíčová slova: karcinom, PCR, papillomaviry
Cíl řešení: Karcinom děložního čípku, v celostátním měřítku druhý nejčastější zhoubný nádor u žen, je pravděpodobně konečným stadiem procesu zahájeného infekcí děložního čípku lidskými papillomaviry (HPV). Do dnešního dne bylo charakterizováno přibližně 30 typů HPV, které infikují slizniční epithely. Geografická distribuce HPV se mezi jednotlivými zeměmi podstatně liší. Spektrum papillomavirů ve střední a východní Evropě nebylo zatím systematicky prověřeno, když dosud provedené studie v České republice naznačují, že prevalence nejdůležitějších typů HPV je u nás podobná jako v západní Evropě. Cílem bylo určit prevalentní biologické spektrum lidských papillomavirů u žen v České republice za použití současně nejúčinnější metody, t.j. polymerázové řetězové reakce, s využitím směsi primerů. Tato metoda umožňuje izolaci, klonování a charakteristiku nových regionálně důležitých typů a variant HPV. Projekt byl též úvodní studií pro budoucí široký screening, který by mohl nalézt ženy, které mají vyšší riziko vzniku a progrese onemocnění.
Studium patogeneze neoplázií děložního čípku vyvolaných papillomaviry
Doba řešení: 1997-1999
Grant IGA MZ 4070.
Hlavní řešitel: RNDr. Eva Hamšíková, Ústav hematologie a krevní transfúze,
RNDr. Ruth Tachezy Ph.D., Ústav hematologie a krevní transfúze
Klíčová slova: papillomaviry, prekanceróza, protilátky, DNA
Cíl řešení: Stanovit úlohu lidských papillomavirů při vzniku a rozvoji histopatologických cervikálních nálezů intraepiteliální leze dlaždicového epitelu nízkého (LG SIL) a vysokého stupně (HG SIL) stupně, které v některých případech předcházejí rozvoji karcinomu děložního čípku. Dále definiovat význam perzistentní infekceHPV po chirurgickém ošetření příslušných lezí na případné rekurence, význam přítomnosti a eventuelních změn v hladinách protilátek proti vybraným antigenům, odvozeným od virově specifických proteinů rizikových tyypů HPV a zlepšení diagnostiky nemocí vyvolaných HPV.
Úloha HPV v progresi suspektivních cervikálních cytologických nálezů (ASCUS/AGUS)
Doba řešení: 2000-2002
Grant IGA MZ NC5959
Hlavní řešitel: RNDr. Eva Hamšíková, Ústav hematologie a krevní transfúze
Klíčová slova: papillomavirus, karcinom děložního čípku, ASCUS/AGUS, HPV DNA, PCR, Hybrid Capture II, protilátky proti HPV, VLP
Cíl řešení: Objasnění vztahu mezi projevy infekce vysoce rizikovými typy genitálních papillomavirů (HPV DNA, imunologická odpověď) a progresí suspektních cytologických nálezů ASCUS/AGUS. Porovnání citlivosti a specifity PCR a Hybrid Capture II pro detekci HPV DNA v cervikálních stěrech, zhodnocení využitelnosti Hybrid Capture II systému pro management pacientek s hraničním cytologickým nálezem ASCUS/AGUS.
Úloha papillomavirů při vzniku nádorových a nenádorových onemocnění mužského urogenitálního traktu
Doba řešení: 2000-2002
Grant IGA MZ NI6077
Hlavní řešitel: RNDr. Ruth Tachezy Ph.D., Ústav hematologie a krevní transfúze
Spoluřešitel: Doc. MUDr. Michael Urban, Fakultní nemocnice Královské Vinohrady
Klíčová slova: urogenitální, HPV, rezervoár, maligní, prostata, močový měchýř
Cíl řešení: Identifikovat rezervoár HPV v mužském urogenitálním traktu. Zjistit jakou roli hrají HPV při vzniku maligních a nemaligních onemocnění. Materiál odebírat při otevřených chirurgických výkonech, kde nehrozí jeho kontaminace HPV z uretry.
Studium epidemiologie TT viru metodami molekulární biologie
Doba řešení: 2000-2003
Grant GAČR 310/00/1060
Hlavní řešitel: RNDr. Ruth Tachezy Ph.D., Ústav hematologie a krevní transfúze
Spoluřešitel: RNDr. Vratislav Němeček CSc., Státní zdravotní ústav
Klíčová slova: TTV, PCR, hepatitida, přenos
Cíl řešení: Stále ještě existují případy posttransfuzních akutních a chronických hepatitid, jejichž etiologie je neznámá a zdá se, že ani nedávno objevený virus hepatitidy G (HGV) není etiologickým faktorem těchto onemocnění. V roce l997 byl objeven nový virus nazvaný TTV. TTV byl zjištěn u 12-62% dárců krve, zvýšená prevalence tohoto viru byla zjištěna u pacientů s hemofilií, hemodialyzovaných a pacientů s beta-thalasemií, což ukazuje, že hlavní způsob přenosu infekce TTV je parenterální. Také další cesty přenosu infekce TTV nelze zatím zcela vyloučit. Studie ukazují, že se TTV může podílet na etiologii některých virových hepatitid. Vypracování metod pro detekci TTV, zjištění prevalence viru v populaci, zejména u dárců krve a ve skupinách s rizikem parenterálního přenosu je velmi potřebné, protože o výskytu TTV v České republice nejsou žádné údaje. Zjištění prevalence TTV ve skupinách s rizikem parenterálního nebo sexuálního přenosu pomůže určit míru rizika v těchto skupinách a zjistit, jaké cesty přenosu TTV se podílí na šíření viru.
Determination of the potential risk of human papillomavirus polymorphisms in cervical cancor development
Doba řešení: 2000-2001
Grant NATO Collaborative Linkage Grant F818
Hlavní řešitel: Dr. Massimo Tommasino, Deutsches Krebsforschungszentrum, Angewandte Tumorvirologie, Heidelberg, Germany
Spoluřešitel: RNDr. Ruth Tachezy Ph.D., Ústav hematologie a krevní transfúze
Klíčová slova: E6, E7, polymorphism, papillomavirus, cervical intraepithelial neoplasia
Cíl řešení: Infection with high-risk human papillomavirus (HPV) is necessary for the development of a cervical lesion, but only a fraction of precursor lesions progress to cancer. Additional factors, other than HPV type per se, are likely to increase the probability for progression. Intratype genome variations of HPV have been reported to be associated with viral persistence and the development of a major cervical disease. The prevalence of specific HPV16-E6 variants varies among the patients and depends on stupy population. The data indicate that host genetic factors, such as HLA polymorphism, may determine the potential oncogenicity of the HPV16-E6.
Význam lidských papillomavirů v etiologii a prognóze karcinomu orofaryngu a dutiny ústní
Doba řešení: 2001-2003
Grant IGA MZ NC6441
Hlavní řešitel: Doc. MUDr. Jan Klozar CSc., Fakultní nemocnice v Motole
Spoluřešitel: RNDr. Ruth Tachezy Ph.D., Ústav hematologie a krevní transfúze
Klíčová slova: orofarynx, dutina ústní, nádor, HPV, PCR, DNA hybridizace, rizikové faktory
Cíl řešení: Zjistit výskyt a typ HPV v tkáni odebrané z nádorů orofaryngu a dutiny ústní pomocí PCR a DNA hybridizace a sekvenace. U stejných pacientů a u zdravých kontrol zjistit výskyt a typ HPV v cytologickém materiálu získaném z výplachu dutiny ústní. Zjistit, zda přítomnost a typ HPV je nezávislým rizikovým faktorem vzniku orofaryngeálního a orálního karcinomu. Zjistit, zda některé další faktory (životní styl a návyky) jsou také nezávislými rizikovými faktory pro vznik těchto nádorů. U pacientů s nádory a u zdravých kontrol zjistit prevalen i protilátek proti HPV. Sledovat hladinu protilátek v závislosti na klinickém vývoji. Zjistit, zda přítomnost HPV specifických protilátek může sloužit jako marker rizika vzniku karcinomu nebo jeho recidivy.
HPV and other risk factors of oral cavity/ oropharyngeal cancer
Doba řešení: 2001-2004
Grant NIH FIRCA 1R03TW001500-01.
Hlavní řešitel: Prof. Elaine Smith, College of Public Health, University of Iowa, Iowa City, USA
Spoluřešitel: RNDr. Ruth Tachezy Ph.D., Ústav hematologie a krevní transfúze
Klíčová slova: oropharynx, oral cavity, tumors, HPV, PCR, DNA hybridization, risk factors
Cíl řešení: To determine the prevalence and types of HPV DNA in histology speciment of oropharyngeal and oral cavity cancer and to determine, whether HPV DNA positive and negative cases differ in epidemiological and clinical features such as gender, age, tabaco, location and extent of tumor.
Vztah HPV k anogenitálním nádorům
Doba řešení: 2003-2005
Grant IGA MZ NC7548
Hlavní řešitel: RNDr. Eva Hamšíková, Ústav hematologie a krevní transfúze
Spoluřešitel: Doc. MUDr. Ladislav Horák DrSc., 3. lékařská fakulta, Univerzita Karlova v Praze
Klíčová slova: HPV infekce, vulvární karcinom, anální karcinom, PCR, HPV DNA, HPV protilátky, HPV typizace
Cíl projektu: Zjistit úlohu HPV infekce ve vzniku vulvárních spinocelulárních karcinomů typu I a typu II detekcí DNA pomocí PCR v biopsiích prekancerózních a nádorových lézích a stanovením prevalence specifických protilátek v sérech pacientek Zjistit úlohu HPV infekce ve vzniku análních spinocelulárních karcinomů detekcí HPV DNA pomocí PCR v biopsiích prekancerózních a nádorových lézích a stanovením prevalence specifických protilátek v sérech pacientek. Porovnat prevalenci HPV specifických protilátek v sérech nemocných a vybraných zdravých kontrol, porovnat typ přítomného HPV se specifitou přítomných protilátek.
Prevalence protilátek proti TT viru v populaci České republiky
Doba řešení: 2006 – 2008
Grant GA ČR GP310/06/P421
Hlavní řešitel: RNDr. Martina Saláková, Ph.D.
Klíčová slova: TTV, protilátky, DNA, Bakulovirus
Cíl projektu: V roce 1997 byl v séru pacienta s potransfuzní hepatitidou nejasného původu identifikován virus, nazvaný TT virus (TTV). TTV je malý DNA virus s kruhovým jednořetězcovým genomem o velikosti okolo 3.8 kb. Přestože se jedná o DNA virus, je TTV velmiheterogenní a do současné doby bylo identifikováno nejméně 40 genotypů, které lze rozdělit do pěti fylogenetických skupin. TTV je rozšířen po celém světě, prevalence dosahuje až 98% u zdravé populace. V České republice je prevalence TTV v normálnípopulaci, kterou reprezentují zdraví dárci krve, 52.6%. V předchozím projektu, který byl řešen v ÚHKT na oddělení experimentální virologie a podporován grantem GAČR 310/00/1060, jsme zjistili zastoupení TTV v ČR ve skupinách dárců, dětí a v rizikovýchskupinách pro sexuální, transplacentární a parenterální přenos. TTV DNA jsme detekovali metodu PCR¸ která udává rozdílné výsledky v prevalenci, v závislosti na použitých primerech. Proto je potřebné vytvořit systém pro přípravu antigenu pro detekci protilátek proti TTV. Výsledky získané v předchozím projektu umožní 1) na souboru vzorků se známým genotypem určeným sekvenací zjistit, zda jsou TTV protilátky typově specifické, či zda reagují zkříženě i s dalšími genotypy, 2) porovnat prevalenci TTV vyjádřenou detekcí TTV DNA a detekcí TTV specifických protilátek, 3) zjistit, zda všichni infikovaní jedinci vytváří specifické protilátky
HPV vakcíny - předvakcinační studie (typově specifická prevalence HPV infekcí v České republice)
Doba řešení: 2006 – 2008
Grant IGA MZd NR8852
Hlavní řešitel: RNDr. Ruth Tachezy, Ph.D.
Klíčová slova: HPV, protilátky, HPV vakcína
Cíl projektu: Před započetím vakcinace proti HPV zjistit prevalenci HPV typů v závažných lézích genitálního traktu a dutiny ústní a krku asociovaných s HPV Před započetím vakcinace proti HPV zjistit prevalenci HPV specifických protilátek v sérech náhodně vybraných zdravých jedinců, sbíraných pro účely sérologických přehledů, dárců krve a pacientů s lézemi asociovanými s HPV
Využití virologických markerů v léčbě a prevenci karcinomu orofaryngu a dutiny ústní
Doba řešení: 2007 - 2009
Grant IGA MZd NR9466
Hlavní řešitel: Doc. MUDr. Jan Klozar, CSc., Fakultní nemocnice v Motole
Spoluřešitel: RNDr. Ruth Tachezy, Ph.D.
Klíčová slova: orofarynx, dutina ústní, nádor, HPV, PCR, DNA hybridizace, rizikové faktory
Cíl projektu: Studie ověří, zda se z klinického hlediska skupina pacientů s HPV pozitivními nádory liší od nemocných s HPV negativními nádory. Výsledky studie přispějí k časnější diagnostice především recidiv a k přesnějšímu sledování po léčbě pomocí molekulárně biologických a sérologických metod a tím k prevenci recidiv. Mohou mít vliv i na volbu optimální léčebné metody a radikality léčby. Zlepšení základních ukazatelů výsledků onkologické léčby je evidentním přínosem z pohledu pacienta, ale i z hlediska socioekonomického. Zavedení biomarkeru pro včasnou diagnostiku těchto nádorů by mělo vliv i na snížení nákladů na léčbu. Výsledky budou významným příspěvkem k řadě výzkumů zjišťujících možnou roli HPV jako etiologického faktoru orofaryngeálního a orálního karcinomu. Studie též zjistí typovou specificitu HPV v české populaci, což představuje cennou informaci pro přípravu vakcinace v ČR. Umožní rovněž vyčíslit počet pacientů s HPV asociovanými nádory ORL oblasti v ČR.
Typově specifická prevalence HPV ve screeningové populaci žen
Doba řešení: 2009- 2011
Grant GA MZd NC 10 656-3
Řešitel: RNDr. Ruth Tachezy, PhD.
Cíl projektu: Zjištění věkově závislé prevalence HPV ve stěru z děložního hrdla v populaci žen v ČR, které se účastní preventivních gynekologických vyšetření (oportunního screeningu), zjištění rozložení typů HPV v této skupině žen a porovnaní HPV nálezů ve skupině žen bez klinického nálezu a žen se suspektním nebo patologickým nálezem na děložním hrdle, rekrutujících se z této screeningové populace. Porovnat běžně používanou metodu detekce vysoko-rizikových (HR) typů HPV a vysoce specifickou a citlivou metodu detekce a typizace HPV z hlediska detekce spektra HR HPV vyskytujících se v české populaci.